Ассоциация государственных научных центров "НАУКА"
Ассоциация государственных научных центров "НАУКА"
Структурная биология, изучающая строение биомакромолекул и элементов клетки на
всех уровнях ее организации, является одним из основных инструментов развития
современной биологии. В НИЦ «Курчатовский институт» создана вся необходимая
инфраструктура для решения задач структурной биологии, в частности, функционирует
Система роботизированной кристаллизации макромолекул (СРКМ), которая является
элементом технологической платформы НБИКС-Центра по применению метода
рентгеноструктурного анализа для изучения пространственной структуры макромолекул и
их комплексов.
Общая информация
Назначение:
СРКМ, функционирующая в отделе "Белковая фабрика" НБИКC-Центра НИЦ
«Курчатовский институт», позволяет в полуавтоматическом режиме проводить скрининг
первоначальных условий кристаллизации белков (и/или их комплексов) и является
единственной в России системой подобного уровня.
Основными преимуществами данной системы являются:
• Значительное ускорение рутинной операции перебора условий кристаллизации белков;
• Существенная экономия экспериментального материала;
• Отсутствие случайных ошибок, вызванных «человеческим фактором»;
• Возможность удаленного контроля эксперимента.
Характеристики системы:
Метод исследования: кристаллизация методом диффузии в парах.
Тип используемых планшетов: 96-и луночные standard и low-profile; сидячая капля.
Расход образца на лунку: от 100 нл.
Минимальное количество образца на планшет: 70 мкл.
Стандартный протокол кристаллизации: 6 (одна температура) или 12 (две
температуры) планшетов.
Скорость раскапывания одного кристаллизационного планшета: ~ 1 мин.
Количество различных условий кристаллизации на планшет: до 288.
Температура кристаллизации: настраиваемая, стандартно +4 и/или +20 °С.
Срок хранения (мониторинга) планшета в инкубаторе: любой (стандартно - 8
месяцев).
Возможность удаленного доступа к экспериментальным данным: посредством
Интернет.
Предлагаемые сервисы
СРКМ является высокотехнологичным оборудованием. Непосредственный доступ к
нему сторонних пользователей не допускается. Все необходимые операции проводятся
квалифицированными научными сотрудниками отдела «Белковая фабрика» НБИКC-
Центра НИЦ «Курчатовский институт». Сторонним пользователям предоставляются
следующие сервисы:
• Определение первоначальных условий кристаллизации (скрининг)
• Оптимизация первоначальных условий кристаллизации и предварительный
анализ качества полученных кристаллов
Дополнительные услуги, оказываемые по согласованию:
• Очистка/доочистка экспериментального материала пользователя
• Сбор дифракционных данных, их обработка, решение и получение
уточненной пространственной структуры, готовой к депонированию в банк
данных.
• Анализ полученной структуры.
Условия работы
Работа на СРКМ для бюджетных научных учреждений проводится на
безвозмездной основе. При этом преимущественным правом использования рабочего
времени СРКМ обладают организации, реализующие совместные с НИЦ «Курчатовский
институт» проекты. Для коммерческих организаций существует платная форма доступа.
Стоимость работ согласовывается в каждом случае индивидуально.
Существует возможность проведения учебных лабораторных работ по
кристаллизации белков с использованием СРКМ для групп студентов.
Учебно-методический комплекс
В рамках реализации Федеральной целевой программы «Развитие инфраструктуры
наноиндустрии в Российской Федерации на 2008-2011 годы» для СРКМ был разработан
программный мультимедийный учебно-методический комплекс (УММК),
предназначенный для обеспечения свободного доступа к ресурсам системы широкого
круга российских ученых, преподавателей, аспирантов, а также студентов профильных
специальностей. УММК содержит базу литературы по тематике рентгеноструктурного
анализа, а также смежным дисциплинам, позволяет планировать эксперимент в удаленном
режиме, а также проводить обучение и тестирование. УММК может быть использован в
образовательных целях для подготовки новых и повышения квалификации существующих
кадров в профильных областях науки.
Доступ к УММК осуществляется посредством сети Интернет по ссылке:
«http://biocrystal.kiae.ru». Для работы на УММК необходимо пройти он-лайн
регистрацию.
Источник: http://www.kiae.ru/